ランダムに選択された相手がもつデッキと自分のデッキで殴り合いを行うものです。
デッキ構築以外は対戦が始まったら祈ることしか出来ません。
開催期間は月曜日の19時位から次週の月曜日の16時まで。リーグ戦の報酬は17時頃に配布される模様。
クランランキングは2週分の合算で集計されます。
終了日が祝祭日の場合、期間が一日延びる場合がある模様。
ただし、延びなかったこともある。

リーグ戦ごとにボーナスとなるドラゴンが指定されます。
基本的にはそのドラゴンを選択することになりますが、
選択したドラゴン全体的な攻撃回数が低い場合、勝率が大きく下がります。
なので、ボーナス対象かつ、攻撃回数の多いものを選択することになります。

一戦ごとにトロフィーが変動します。
勝利した場合、+9〜+21トロフィーが入ります。
相手に比べ、自分のトロフィー数が少ない場合は相手とのトロフィー差が小さいほどもらえるトロフィー数が減ります。
自分の方がトロフィー数が多い場合は、相手との差が小さくない限り+9でほぼ確定。
これにボーナスドラゴンのトロフィー数が加算されます。
負けた場合、相手とのトロフィー数の差によって失うトロフィー数が計算されます。

• 18〜-42トロフィーとなります。たぶん相手とのトロフィー差の判定は勝利時と一緒で、その2倍失う模様。

ただ、一度-39というポイントがあったので、もしかしたら小数以下が存在する可能性があります。
対戦した相手側は、トロフィー数にはたぶん影響なし。
トロフィー数200差ぐらいですでに+21ポイントになる様子。段階は複数ありそうだが、+9と+21以外の加算値が見られるのはリーグ戦開始直後ぐらいかもしれない。
と思っていたのだが、ポイント差以外にもトロフィ数に変化が生じる要因がありそうなので、もはや考察がめんどくさい。
実際問題としてトロフィー数に影響を出すのはボーナスドラゴンだけで、一戦ごとの細かいトロフィー数は誤差レベル。

リーグ戦ごとにボーナスドラゴンが選出されます。
ボーナスドラゴンを利用すると以下のメリットがあります。
・勝利時の取得ポイントにボーナスがつきます。
・先頭開始時のスキルポイントがボーナス対象外のドラゴンより多い。つまりスキルゲージが貯まりやすい。

土曜日の10時から、該当のリーグ戦終了時間までは取得できるトロフィー中、ボーナスドラゴン分が2倍になります。
また、ゲリライベントとして、夜の場合は19時〜24時、昼の場合は11時〜17時に2倍期間が開催される場合があります。
公式Twitterにてゲリライベントが開始されたらつぶやきが行われます。
当然ゲリラなので予告はありません。概ね週に2回？
フィーバータイムの実装が影響しているのか、週末以外にゲリラ的な2倍期間がなくなった？

大抵夜だけ（19時〜24時、リーグ戦終了日だけ12時〜16時の模様）ですが、バトルオーブを3ついっぺんに使うことができます。
3つつかったからといってなんらかの付加効果があるわけでもなく、1戦の3倍トロフィー数、宝箱ポイント数がもらえるだけです。
つまり1つずつつかって3連勝してもほぼ同じ。時間短縮
実装当初バトルオーブ3つ消化で2倍にしかならなかった。

http://csdra.netgamers.jp/ から引用